Utilisation des microbiotes comme modèles
- Publication : vendredi 21 février 2020 09:10
- Écrit par Monique Zagorec, Marie Champomier-Vergès, Stéphane Chaillou.
Utilisation de consortia bactériens ou de microbiotes complexes comme modèles dans la compréhension des interactions microbiennes des produits carnés : avantages et limites.
Pour comprendre les interactions microbiennes dans les aliments, des cocktails de souches peuvent être constitués à partir de cultures pures et étudiés dans des aliments modèles simplifiés. Des microbiotes complexes récoltés à partir de matrices alimentaires peuvent aussi être utilisés. Ces derniers sont des systèmes plus complexes à modéliser mais proches de la réalité et permettent des expériences reproductibles.
INTRODUCTION
L’utilisation des techniques de séquençage à haut débit a révolutionné notre vision de la microbiologie des aliments. La présence dans les aliments d’espèces non cultivées ou difficiles à cultiver dans les conditions standard ou même d’espèces inconnues a été mise en évidence grâce à ces techniques. Ces méthodes ont également montré que différentes souches d’une même espèce pouvaient cohabiter. Enfin, nous savons maintenant que la dynamique de ces différentes populations au cours de la conservation varie suivant les conditions de stockage (résultant d’interactions abiotiques) et de la nature des espèces partageant une même niche (résultant d’interactions biotiques). L’étude des interactions (biotiques et abiotiques) au sein de ses écosystèmes peut être abordée grâce à la construction de modèles. Une première approche expérimentale est basée sur la constitution des consortia de souches (mélanges d’une ou de plusieurs souches appartenant à une ou plusieurs espèces) et à étudier leur comportement après inoculation sur des aliments modèles ou reconstitués.
Biopréservation et hautes pressions : effet sur les communautés microbiennes
- Publication : lundi 27 janvier 2020 09:10
- Écrit par Monique Zagorec, Marie Champomier-Vergès, Sandrine Guillou, Stéphane Chaillou
Stabilisation des contaminants bactériens des jambons cuits après traitement haute pression et ajout d’une culture protectrice.
Les communautés bactériennes présentes dans les dés de jambon cuit montrent une certaine diversité : elles peuvent être dominées par des firmicutes ou des protéobactéries, dont parfois des espèces jusque-là non cultivées. Ces communautés répondent différemment au traitement haute pression et à la biopréservation. Néanmoins, la combinaison des deux traitements permet de stabiliser le produit, avec envahissement par la souche protectrice.
INTRODUCTION
Les produits carnés réfrigérés sont périssables en raison de l’inévitable contamination bactérienne lors des différentes étapes de fabrication et de la croissance bactérienne lors de la conservation. Différents ingrédients ou additifs, comme le sel ou les sels nitrités, outre leur rôle pour les qualités organoleptiques du produit, contribuent à stabiliser le produit. Dans le cas des produits de charcuterie, tels que les jambons cuits, la diminution des quantités de sels nitrités devient nécessaire pour garantir la santé du consommateur. Cette diminution des doses de sels nitrités est susceptible d’augmenter le risque microbiologique dans ces produits. Par ailleurs des solutions alternatives telles que les traitements à haute pression (HP) et la biopréservation (ajout de cultures protectrices) existent.
Dans ce travail nous avons dans un premier temps déterminé la nature des communautés bactériennes présentes sur des dés de jambon par des méthodes non ciblées (sans a priori), c’est-à-dire par séquençage haut débit, sans phase de culture préalable. Ensuite, nous avons recherché l’effet des traitements Hautes Pressions (HP) et de la biopréservation sur ces communautés bactériennes.
Pour ce faire, nous avons stocké les communautés bactériennes, directement extraites de dés de jambon du commerce, pour pouvoir les inoculer dans des dés de jambons paucimicrobiens (préparés de manière aussi aseptique que possible) de manière à obtenir des produits cuits standardisés et proches des conditions réelles. Cette approche nous a permis de suivre la dynamique de ces communautés lors du stockage, après application des traitements.
Dans ce travail nous avons dans un premier temps déterminé la nature des communautés bactériennes présentes sur des dés de jambon par des méthodes non ciblées (sans a priori), c’est-à-dire par séquençage haut débit, sans phase de culture préalable. Ensuite, nous avons recherché l’effet des traitements Hautes Pressions (HP) et de la biopréservation sur ces communautés bactériennes.
Pour ce faire, nous avons stocké les communautés bactériennes, directement extraites de dés de jambon du commerce, pour pouvoir les inoculer dans des dés de jambons paucimicrobiens (préparés de manière aussi aseptique que possible) de manière à obtenir des produits cuits standardisés et proches des conditions réelles. Cette approche nous a permis de suivre la dynamique de ces communautés lors du stockage, après application des traitements.
Présentation du projet BLacHP (2015-2019)
- Publication : mardi 14 janvier 2020 09:25
- Écrit par Jean-Marie Perrier-Cornet et Hélène Simonin
Présentation du projet ANR BLacHP : « Bactéries Lactiques combinées avec Hautes Pressions pour un procédé durable de stabilisation des produits carnés réfrigérés ».
Le projet BlacHP a permis d’étudier une nouvelle stratégie pour contrôler la qualité microbiologique des produits carnés prêts à consommer, avec une approche pluridisciplinaire, autour du fil rouge du développement de dés de jambon à teneur réduite en nitrites.
INTRODUCTION
En Europe, le marché des aliments prêts à consommer cuits et réfrigérés contenant de la viande est en constante augmentation (FMI, 2016). Ces aliments ont souvent subi des traitements thermiques doux avec des températures maximales atteignant 65 à 95 °C avant d’être conditionnés sous vide ou sous atmosphère modifiée, puis réfrigérés. Ces conditions de traitement, conçues pour maîtriser les flores végétatives indésirables, peuvent cependant donner un avantage sélectif au développement de bactéries sporulantes psychrotrophes potentiellement pathogènes des genres Bacillus et Clostridium (Notermans et al., 1990). Le contrôle de ces bactéries, en particulier les espèces des groupes des Bacillus cereus et des Clostridium botulinum non protéolytiques, devient donc un enjeu important pour la sécurité alimentaire (Rowswell, 2017). Dans les produits contenant de la viande, en particulier les produits à teneur en sel réduite et ayant une durée de conservation supérieure à 10 jours, l’addition de sels de nitrites à une concentration comprise entre 50 et 150 mg/kg est nécessaire pour inhiber la germination et la croissance de C. botulinum (EFSA, 2003). L’utilisation de conservateurs, tels que les nitrites dans les aliments, est cependant pointée du doigt par les consommateurs et les medias du fait de leur potentiel effet cancérigène (EFSA, 2017). Les professionnels des produits carnés sont donc incités à rechercher des alternatives à l’utilisation d’additifs, et en particulier des nitrites. La diminution des nitrites peut s’avérer problématique en raison de leurs propriétés technologiques (développement de la couleur rose et flaveur) et antibactériennes, et certains ajustements sont nécessaires pour maintenir la sécurité et la qualité des produits. Pour résoudre ce problème, des technologies alternatives doivent être investiguées.
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Edito : De l’intérêt de publier ses travaux
Il y a un peu plus de 10 ans, la revue VPC accomplissait sa révolution numérique. L’antique magazine papier bicolore créé dans les années 1970 disparaissait au profit d’un site internet et d’une lettre d’information envoyée chaque trimestre par courriel. Le bilan de cette transformation est très positif. Le nombre d’abonnés n’a cessé de croitre en une décennie, frôlant aujourd’hui les 6000, sans aucune campagne promotionnelle. Les articles scientifiques publiés sous l’autorité des comités de relecture sont lus et téléchargés à chaque numéro plusieurs centaines de fois, pour certains repris dans d’autres articles de la communauté scientifique, pour d’autres cités dans la presse professionnelle.
En dépit de ces résultats, nous avons constaté ces derniers mois une baisse substantielle du nombre d’articles proposés à Viandes&Produits Carnés, et ce quelle que soit leur provenance, académique et géographique ou la catégorie éligible : process et technologie, nutrition, hygiène et sécurité sanitaire, environnement, économie et consommation, bien-être animal. Cet éditorial n’est pas le lieu pour explorer les raisons de ce reflux sans doute largement lié à la conjoncture actuelle. Il constitue cependant l’occasion de rappeler tout l’intérêt de publier les résultats d’études expérimentales, d’évaluations ou de points de vue sur l’élevage et la viande. La publication permet de valider les acquis de ses travaux par la communauté scientifique et participe à la reconnaissance des recherches par les donneurs d’ordre publics, interprofessionnels, et privés. Elle contribue également à une large diffusion des travaux auprès des professionnels du secteur dont la curiosité pour les questions scientifiques, les chiffres en témoignent, n’a jamais été aussi grande.
La publication de travaux scientifiquement étayés prend d’autant plus d’importance dans une période au cours de laquelle l’élevage et la production de viande sont exposés à des remises en cause radicales, sur la base d’arguments parfois fallacieux. "Les systèmes d'élevage doivent progresser sur la base des connaissances scientifiques les plus récentes et non à partir de simplifications, de raccourcis ou de parti-pris", estime ainsi une "Déclaration de Dublin" publiée au lendemain du "Sommet international sur le rôle de la viande dans la société" et d’ores et déjà signée par plus de 540 scientifiques du monde entier.
Cette déclaration, nous vous en proposons, dans cette nouvelle édition de Viandes&Produits Carnés, une traduction en français, ainsi que le texte original. Dans ce même numéro, nous vous proposons également un article sur la production de viande bovine en Algérie, un autre sur l’évolution de la consommation de viande en France en 2021, un point de vue sur le bien-fondé des critiques à l’égard de la viande bovine ou encore une évaluation de l’impact de la baisse de consommation de viande chez les enfants et adolescents par Patrick Tounian, professeur de pédiatrie à la faculté de médecine Sorbonne Université et praticien hospitalier à l'hôpital Trousseau.
A vos contributions, donc !
Jean-François HOCQUETTE et Bruno CARLHIAN
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